入試情報 入試情報 150th Anniv. 150th Anniv.
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日本医科大学

Fields / Departments分野（教室）

Department of Biochemistry and Molecular Biology 生化学・分子生物学（代謝・栄養学）

私たちの生化学・分子生物学（代謝・栄養学）教室（旧生化学第一講座）は、1936年の創立以来80年以上に亘り、多くの指導的な生化学者を輩出するとともに、臨床から大学院生・研究生を受け入れ、優れた臨床研究者を育ててきた伝統ある教室です。

この長い歴史の中で、当教室は生化学領域における基盤的かつ応用的な課題に取り組むべく、一貫して蛋白質の構造と機能、蛋白質相互作用、先天性代謝異常症の原因解明を軸に、多くの国内外共同研究を展開してきました。当教室が重点的に取り組んできた代表的研究として、（1）先天性骨系統疾患である低ホスファターゼ症における骨石灰化障害の分子基盤解明、（2）金属酵素が関わるレドックス微細構造機能解析と安定同位体アミノ酸ラベル導入用の新規大腸菌発現宿主株コレクション開発・公開、（3）痛風の発症に関わるキサンチン酸化還元酵素キサンチン酸化還元酵素（Xanthine Oxidoreductase; XOR）による触媒反応・活性酸素産生機構、薬剤結合型構造の解明などが挙げられます。特に、XOR研究は抗痛風薬であるフェブリクとトピロキソスタットの開発につながった社会的にもインパクトの大きい研究です。いずれのテーマも、生命現象を分子レベルで理解することを目的とし、基礎生化学の視点を起点としつつ、ヒト疾患の理解やこれらに対する有効な新規治療・予防法の開発へとつながる高い波及性を持つものです。2018年より、前任の大石由美子教授を中心に、これまでの研究基盤を継承・発展させつつ、現代医療が直面する加齢関連疾患や生活習慣病に焦点を当てた研究が展開され、高度オミクス解析や分子イメージングなどの先進技術を用い、代謝恒常性の破綻がどのようにしてこれらの疾患発症に結びつくのかが研究されました。

佐藤 卓

生化学・分子生物学(代謝・栄養学) /
代謝・栄養学
大学院教授　 佐藤 卓

2023年10月より佐藤が当教室の主宰を引き継ぎ、新たな研究テーマとして、ヒトがんに特化した研究を開始しました。がんは言うまでもなく、現在においても世界的な主要死因の一つであり、その発症や進展に関わる分子機構の解明は、現代医学における最重要課題の一つです。生化学は、細胞内で起こる分子レベルの現象を対象とする学問であり、がんという複雑な病態を根本から理解するうえで、不可欠な視点を提供します。細胞増殖やアポトーシス、エネルギー代謝、さらには細胞間のシグナル伝達といった、がんの本質に関わる生命現象は、生化学的手法による解析なしには十分に語れません。とりわけ近年では、腫瘍細胞における代謝リプログラミングや、特定の代謝酵素の異常発現ががんの悪性化や治療抵抗性に深く関与することが明らかになっており、生化学的アプローチの重要性はかつてないほどに高まっています。

こうした背景を踏まえ、当教室ではがん研究における生化学的アプローチのさらなる深化を目指し、ユニークな研究資源として「患者由来がんオルガノイド」を活用しています。これは、実際の患者の腫瘍組織から樹立された三次元培養がん細胞株であり、従来のがん細胞株と比べ、患者の腫瘍本来の性質を試験管内に忠実に再現できる点が大きな特長です。こうした細胞を用いることで、個々のがんに特有の代謝経路の異常や、薬剤耐性を引き起こす分子メカニズムなど、従来の手法では捉えきれなかった新たな知見が得られつつあります。実際に、患者由来がんオルガノイドモデルを用いた我々の最新研究においては、治療抵抗性と強く関連する特定の代謝経路の変化が明らかとなり、これががんの再発や患者予後に深く関与する可能性が示唆されます（Nakagawa & Sato et al. Commun Biol. 8, 507 (2025), Sase & Sato et al. Dev Cell. 60, 396-413.e6 (2025)）。今後もこうしたモデルを用いた研究を通じて、がんの本質に迫る分子レベルでの理解を進め、新たな治療戦略の構築につなげていきたいと考えています。

本学の特色の一つは、臨床と基礎研究との垣根が低く、医学部附属病院との密な連携のもとで研究を進められる環境にある点です。実際の臨床現場から得られる知見や課題を研究にフィードバックし、基礎の成果を再び臨床に還元する「ベンチからベッドサイドへ、そしてベッドサイドから再びベンチへ」という双方向的なアプローチは、本学ならではの強みです。このような環境で行う生化学研究は、単なる基礎的知見の蓄積にとどまらず、実際のがん診療に直結する成果を生み出す可能性を秘めています。

我々は今後も、生化学の視点から様々な疾患の本質に迫る研究をさらに推進し、新たな診断・治療法の開発に貢献することを目指すとともに、次世代の研究者・医療人材の育成にも積極的に取り組んでいきます。

  • 主な研究内容

    1. 患者由来オルガノイドで挑む　ヒトがんの解明と再発制御

    （大学院教授　佐藤　卓）


    がん治療では集学的治療により腫瘍量を一時的に抑えられても、生き残った治療耐性がん細胞が再発の原因となり、治療成績向上の大きな障壁となっています。したがって、治療抵抗性を示す細胞集団の同定と制御は、がんによる死亡の主要因である再発の克服につながり、多くの患者の長期予後改善に寄与すると考えられます。加えて、再発抑制による医療費の削減、長期入院や治療による労働生産性の低下防止、働き盛り世代の社会復帰の促進など、社会経済的な波及効果も極めて大きいといえます。こうした再発の起点となる微小遺残腫瘍は、ごく少数の細胞で構成されており、現在の画像診断技術やリキッドバイオプシーではその存在を捉えることはもとより、その性質を詳細に解析することも極めて困難です。私たちはこの課題に対し、臨床医と連携して患者腫瘍からオルガノイドライブラリーを構築し、シングルセル解析やメタボローム解析といった先進的な技術を駆使することで、再発を引き起こす本質的なメカニズムの解明に取り組んでいます。将来的には、得られた知見に基づいて、がん再発を予防する新たな治療戦略の創出を目指します。


    Sato_Figure_PNG


    参考論文

    1) Nakagawa S*, Sato T*# et al. Commun Biol. 8, 507. (2025) (*:equal contribution, #: co-corresponding)
    2) Sase M*, Sato T* et al. Dev Cell. 60, 396-413.e6. (2025) (*:equal contribution)
    3) Sato T et al. Nat Cell Biol. 22, 919-926. (2020)



    2. 金属酵素の構造機能解析と大腸菌アミノ酸要求性発現宿主株開発

    （講師　岩崎 俊雄）

    研究内容・業績等の委細については、リンク先の研究ホームページ
    https://fesworld.jp/ をご参照ください。


    参考論文
    1) Iwasaki T et al. J. Am. Chem. Soc. 131, 13659-13667. (2009)
    2) Iwasaki T et al. J. Am. Chem. Soc. 134, 19731-19738. (2012)
    3) Iwasaki T et al. J. Biochem. (Review) 169, 387-394. (2021)



    3. 食品因子が関わる「自然免疫シグナルネットワーク」のしくみを解き

    明かす ～感染症・がん・炎症性疾患に対する体の防御メカニズムを探る～

    （講師　早川 清雄）


    私たちの体には、細菌やウイルス、がん細胞などの“外敵”から身を守るための仕組みが備わっています。その中でも、最前線で働くのが「自然免疫（しぜんめんえき）」と呼ばれる防御システムです。
    この研究では、食品因子が、自然免疫の働きにどのように影響するのかを、細胞の情報伝達のネットワーク（＝シグナルネットワーク）に着目して、分子レベルで解析しています。
    自然免疫は、感染症、がん、慢性炎症、自己免疫疾患など、さまざまな病気の発症や進行にも深く関わっていることがわかってきました。食品因子が自然免疫に与える影響を明らかにすることで、将来的な病気の予防や新しい治療法の開発につなげることを目指しています。


    Hayakawa_Figure_small


    参考論文
    1) Hayakawa S et al. JCI Insight. 7, e138539. (2022)
    2) Hayakawa S*, Shiratori S* et al. Nat. Immunol. 12, 37-44. (2011) (*:equal contribution)
    3) Takaoka A, Hayakawa S et al. Nature. 424, 516-523. (2003)



    4. 哺乳類キサンチン酸化還元酵素

    脱水素酵素 / 酸化酵素変換の分子機構と生理的意義

    （助教　草野 輝男）


    キサンチン酸化還元酵素（XOR）は分子内にモリブドプテリン、鉄硫黄中心、FADを含む金属フラビン酵素です。生体内ではヒトのプリン代謝の最終ステップを触媒する尿酸産生酵素として働き、痛風治療薬のターゲットになっています。さらに生体内で活性酸素を産生する分子として、虚血再灌流障害をはじめとする多くの病態に関与する報告があり、臨床医学的にも重要です1)。哺乳類 XOR の特徴として活性変換が知られています。XORは通常は脱水素酵素活性を示し、尿酸生成にともない NADH を産生しますが、構造変化をおこし酸化酵素型に変換されると活性酸素を産生します。この活性変換は、従来は炎症や障害された組織などに起こる病理的な現象と考えられてきましたが、最近の研究において乳汁や口腔粘膜では他の分子と協調して引き起こされる局所免疫の一環であることを明らかにしました（図）2)。この自然免疫機構は XOR の活性変換をトリガーとしており、痛風治療薬として利用されている XOR 阻害剤で抗菌作用をコントロールできるため、現在は臨床応用につなげる研究に取り組んでいます。


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    参考文献
    1) Kusano T et al. Redox Biol. 59, 102573.(2023)
    2) Kusano T et al. Nat Commun. 10, 4904. (2019)



    5. ネオ・セルフ抗体産生による自己抗体の探索と、頸管熟化機構の解明

    （助教　片山 映）


    ・流産・死産を反復する不育症患者のうち、自己免疫疾患の症状を示すが、病因が不明な患者が存在する。非免疫細胞由来のネオ・セルフ抗原－抗体は、古典的な適応免疫の開始メカニズムとは異なる産生機構で発現し、その一部は不育症の病因となっている。そこで、未知の自己抗原の探索として、iPS細胞や初代培養細胞によるネオ・セルフ抗体産生機構に基づいた解析を行っている(図1)。現在、炎症刺激により、細胞表面に提示れたMHCクラス2複合体に含まれる抗原候補タンパク質の同定法を確立し、さらに患者検体への適応を進めている。

    ・妊娠中期より頸管熟化が進み早産となる病態は、妊娠の維持に関わるホルモンのプロゲステロン(P4)の感受性が要因の一つとされる。線維芽細胞は頸管を構成する主要な細胞で、P4受容体による転写調節機構により、細胞外マトリクスのコラーゲンを制御している。早産時の頸管熟化の分子機構について、患者検体由来の初代培養細胞を用いた解明を行っている。


    Katayama_Figure


    参考文献
    1) Kuwabara Y, Katayama A, et al. PLOS one. 13, e0198472. (2018)
    2) Kuwabara Y, Katayama A, et al. Am J Reprod Immunol. 78 (2017)



    6. 遺伝性疾患に関わるジスルフィド結合をもつタンパク質の構造・機能解析

    （助教　松村 智裕）


    タンパク質は立体構造が正しく形成されることで特定の機能を果たします。タンパク質の高次構造（三次、四次構造）を構成する重要な化学結合にジスルフィド結合（S-S 結合）があります。私たちは、分子内（三次構造）あるいは分子間（四次構造）のS-S 結合が可逆的に変換することで機能が変化するタンパク質に着目し解析を行っています。
    研究を始めるきっかけとなったXanthine Oxidoreductase (XOR)は、分子内S-S 結合の有無で酸化酵素から脱水素酵素へと可逆的に変換されることが解明されています。またPeroxiredoxin I (Prx I)は、二量体と十量体の2つの構造によってペルオキシダーゼ活性が調節されていることを、分子間のS-S 結合に関わるCys残基の変異体を用いることで明らかにしました。これらについてはタンパク質のX線結晶構造解析にも成功しています(1, 2)。近年の研究では、遺伝子性疾患に関わるアルカリフォスファターゼ（ALP）とコクリン（Cochlin）に着目して構造・機能解析を行っています。組織非特異的に発現するALPは分子内S-S 結合が1カ所存在し、このCys残基が変異すると活性が著しく低下して低ホスファターゼ症を発症することが知られています。また、コクリンは内耳に特に多く発現するタンパク質であり遺伝性難聴DFNA9の原因遺伝子とされています。N-末端ドメインが切断されたCochlin tomo-protein (CTP)は内耳の外リンパに特に多く分泌されています(3)。CTPは外リンパ瘻疾患を鑑別するバイオマーカーとして体外診断薬が開発され2022年に保険収載されました。CTPには保存性の高い4つのCys残基が存在し、分子内で2組のS-S 結合が形成されていると考えられていますが、その機能についてはまだよくわかっていません。これらALPやCTPについて、組換えタンパク質を用いたin vitroリフォールディングの手法を一つの足がかりとして、S-S 結合が持つ重要な機能の解明を目指しています。


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    参考文献

    1) Yamaguchi Y, Matsumura T, et al. J. Biochem. 141, 513-24. (2007).
    2) Matsumura T, et al. J. Biol. Chem. 283, 284-93. (2008).
    3) Ikezono T, Matsumura T, et al. PLoS One. 13, e0191498. (2018)

  • 主な発表論文

    大学院教授　佐藤 卓

    1. Sato T. Role of Patient-Derived Tumor Organoids in Advanced Cancer Research. J Nippon Med Sch. 2025;92(3):234-241. doi: 10.1272/jnms.JNMS.2025_92-310. (Review)


    2. Nakagawa S*, Sato T*, Ohashi E*, Kajita M*, Miya F, Yamamoto K, Yotsumata H, Yamaguchi K, Nakajima Y, Miura A, Kinugasa Y, Ohteki T. An organoid library of human esophageal squamous cell carcinomas (ESCCs) uncovers the chemotherapy-resistant ESCC features. Commun Biol. 2025 Apr 1;8(1):507. doi: 10.1038/s42003-025-07869-4. (*: equal contribution, #: Co-corresponding author)


    3. Sase M*, Sato T*, Sato H, Miya F, Zhang S, Haeno H, Kajita M, Noguchi T, Mori Y, Ohteki T. Comparative analysis of tongue cancer organoids among patients identifies the heritable nature of minimal residual disease. Dev Cell. 2025 Feb 3;60(3):396-413.e6. doi: 10.1016/j.devcel.2024.10.007. (*: equal contribution)


    4. Kanayama M, Izumi Y, Akiyama M, Hayashi T, Atarashi K, Roers A, Sato T, Ohteki T. Myeloid-like B cells boost emergency myelopoiesis through IL-10 production during infection. J Exp Med. 2023 Apr 3;220(4):e20221221. doi: 10.1084/jem.20221221.


    5. Minamide K*, Sato T*, Nakanishi Y, Ohno H, Kato T, Asano J, Ohteki T. IRF2 maintains the stemness of colonic stem cells by limiting physiological stress from interferon. Sci Rep. 2020 Sep 8;10(1):14639. doi: 10.1038/s41598-020-71633-3. (*: equal contribution)


    6. Sato T, Ishikawa S, Asano J, Yamamoto H, Fujii M, Sato T, Yamamoto K, Kitagaki K, Akashi T, Okamoto R, Ohteki T. Regulated IFN signalling preserves the stemness of intestinal stem cells by restricting differentiation into secretory-cell lineages. Nat Cell Biol. 2020 Aug;22(8):919-926. doi: 10.1038/s41556-020-0545-5.


    7. Sato T*, Sase M*, Ishikawa S, Kajita M, Asano J, Sato T, Mori Y, Ohteki T. Characterization of radioresistant epithelial stem cell heterogeneity in the damaged mouse intestine. Sci Rep. 2020 May 22;10(1):8308. doi: 10.1038/s41598-020-64987-1. (*: equal contribution)


    8. Kanayama M, Izumi Y, Yamauchi Y, Kuroda S, Shin T, Ishikawa S, Sato T, Kajita M, Ohteki T. CD86-based analysis enables observation of bona fide hematopoietic responses. Blood. 2020 Sep 3;136(10):1144-1154. doi: 10.1182/blood.2020004923.


    9. Nakanishi Y, Sato T, Takahashi K, Ohteki T. IFN-γ-dependent epigenetic regulation instructs colitogenic monocyte/macrophage lineage differentiation in vivo. Mucosal Immunol. 2018 May;11(3):871-880. doi: 10.1038/mi.2017.104.


    10. Kawamura S, Onai N, Miya F, Sato T, Tsunoda T, Kurabayashi K, Yotsumoto S, Kuroda S, Takenaka K, Akashi K, Ohteki T. Identification of a Human Clonogenic Progenitor with Strict Monocyte Differentiation Potential: A Counterpart of Mouse cMoPs. Immunity. 2017 May 16;46(5):835-848.e4. doi: 10.1016/j.immuni.2017.04.019.


    11. Asano J, Sato T, Ichinose S, Kajita M, Onai N, Shimizu S, Ohteki T. Intrinsic Autophagy Is Required for the Maintenance of Intestinal Stem Cells and for Irradiation-Induced Intestinal Regeneration. Cell Rep. 2017 Aug 1;20(5):1050-1060. doi: 10.1016/j.celrep.2017.07.019.


    12. Yokoi T, Yokoi K, Akiyama K, Higuchi T, Shimada Y, Kobayashi H, Sato T, Ohteki T, Otsu M, Nakauchi H, Ida H, Ohashi T. Non-myeloablative preconditioning with ACK2 (anti-c-kit antibody) is efficient in bone marrow transplantation for murine models of mucopolysaccharidosis type II. Mol Genet Metab. 2016 Nov;119(3):232-238. doi: 10.1016/j.ymgme.2016.08.003.


    13. Kobayashi H, Kobayashi CI, Nakamura-Ishizu A, Karigane D, Haeno H, Yamamoto KN, Sato T, Ohteki T, Hayakawa Y, Barber GN, Kurokawa M, Suda T, Takubo K. Bacterial c-di-GMP affects hematopoietic stem/progenitors and their niches through STING. Cell Rep. 2015 Apr 7;11(1):71-84. doi: 10.1016/j.celrep.2015.02.066.


    14. Nakanishi Y, Sato T, Ohteki T. Commensal Gram-positive bacteria initiates colitis by inducing monocyte/macrophage mobilization. Mucosal Immunol. 2015 Jan;8(1):152-60. doi: 10.1038/mi.2014.53.


    15. Sato T, Ikeda M, Yotsumoto S, Shimada Y, Higuchi T, Kobayashi H, Fukuda T, Ohashi T, Suda T, Ohteki T. Novel interferon-based pre-transplantation conditioning in the treatment of a congenital metabolic disorder. Blood. 2013 Apr 18;121(16):3267-73. doi: 10.1182/blood-2012-07-443713.


    16. Ohyagi H, Onai N, Sato T, Yotsumoto S, Liu J, Akiba H, Yagita H, Atarashi K, Honda K, Roers A, Müller W, Kurabayashi K, Hosoi-Amaike M, Takahashi N, Hirokawa M, Matsushima K, Sawada K, Ohteki T. Monocyte-derived dendritic cells perform hemophagocytosis to fine-tune excessive immune responses. Immunity. 2013 Sep 19;39(3):584-98. doi: 10.1016/j.immuni.2013.06.019.


    17. Mashima H, Sato T, Horie Y, Nakagawa Y, Kojima I, Ohteki T, Ohnishi H. Interferon regulatory factor-2 regulates exocytosis mechanisms mediated by SNAREs in pancreatic acinar cells. Gastroenterology. 2011 Sep;141(3):1102-1113.e1-8. doi: 10.1053/j.gastro.2011.05.051.


    18. Tezuka H, Abe Y, Asano J, Sato T, Liu J, Iwata M, Ohteki T. Prominent role for plasmacytoid dendritic cells in mucosal T cell-independent IgA induction. Immunity. 2011 Feb 25;34(2):247-57. doi: 10.1016/j.immuni.2011.02.002.


    19. Asano J, Tada H, Onai N, Sato T, Horie Y, Fujimoto Y, Fukase K, Suzuki A, Mak TW, Ohteki T. Nucleotide oligomerization binding domain-like receptor signaling enhances dendritic cell-mediated cross-priming in vivo. J Immunol. 2010 Jan 15;184(2):736-45. doi: 10.4049/jimmunol.0900726. Epub 2009 Dec 11.


    20. Sato T, Onai N, Yoshihara H, Arai F, Suda T, Ohteki T. Interferon regulatory factor-2 protects quiescent hematopoietic stem cells from type I interferon-dependent exhaustion. Nat Med. 2009 Jun;15(6):696-700. doi: 10.1038/nm.1973.



    講師　岩崎 俊雄

    1. Boos JR, Jandrain HN, Hagiuda E, Taguchi AT, Hasegawa K, Fedun BL, Taylor SJ, Elad SM, Faber SE, Kumasaka T, Iwasaki T, Geldenhuys WJ. Structure and biological evaluation of Caenorhabditis elegansCISD-1/mitoNEET, a KLP-17 tail domain homologue, supports attenuation of paraquat-induced oxidative stress through a p38 MAPK-mediated antioxidant defense response. Adv Redox Res. 2022 Dec;6:100048. doi: 10.1016/j.arres.2022.100048. (Co-corresponding author)


    2. Iwasaki T, Miyajima-Nakano Y, Fukazawa R, Lin MT, Matsushita SI, Hagiuda E, Taguchi AT, Dikanov SA, Oishi Y, Gennis RB. Escherichia coli amino acid auxotrophic expression host strains for investigating protein structure-function relationships. J Biochem. 2021 Apr 29;169(4):387-394. doi: 10.1093/jb/mvaa140. (Corresponding author)


    3. Geldenhuys WJ, Long TE, Saralkar P, Iwasaki T, Nuñez RAA, Nair RR, Konkle ME, Menze MA, Pinti MV, Hollander JM, Hazlehurst LA, Robart AR. Crystal structure of the mitochondrial protein mitoNEET bound to a benze-sulfonide ligand. Commun Chem. 2019;2:77. doi: 10.1038/s42004-019-0172-x.


    4. Taguchi AT, Ohmori D, Dikanov SA, Iwasaki T. g-Tensor Directions in the Protein Structural Frame of Hyperthermophilic Archaeal Reduced Rieske-Type Ferredoxin Explored by 13C Pulsed Electron Paramagnetic Resonance. Biochemistry. 2018 Jul 17;57(28):4074-4082. doi: 10.1021/acs.biochem.8b00438. (Co-corresponding author)


    5. Taguchi AT, Miyajima-Nakano Y, Fukazawa R, Lin MT, Baldansuren A, Gennis RB, Hasegawa K, Kumasaka T, Dikanov SA,     Iwasaki T. Unpaired Electron Spin Density Distribution across Reduced [2Fe-2S] Cluster Ligands by 13Cb-Cysteine Labeling. Inorg Chem. 2018 Jan 16;57(2):741-746. doi: 10.1021/acs.inorgchem.7b02676. (Co-corresponding author)


    6. Lin MT, Fukazawa R, Miyajima-Nakano Y, Matsushita S, Choi SK, Iwasaki T, Gennis RB. Escherichia coli auxotroph host strains for amino acid-selective isotope labeling of recombinant proteins. Methods Enzymol. 2015;565:45-66. doi: 10.1016/bs.mie.2015.05.012. (Co-corresponding author)


    7. Iwasaki T, Fukazawa R, Miyajima-Nakano Y, Baldansuren A, Matsushita S, Lin MT, Gennis RB, Hasegawa K, Kumasaka T, Dikanov SA. Dissection of hydrogen bond interaction network around an iron-sulfur cluster by site-specific isotope labeling of hyperthermophilic archaeal Rieske-type ferredoxin. J Am Chem Soc. 2012 Dec 5;134(48):19731-8. doi: 10.1021/ja308049u. (Co-corresponding author)


    8. Lin MT, Sperling LJ, Frericks Schmidt HL, Tang M, Samoilova RI, Kumasaka T, Iwasaki T, Dikanov SA, Rienstra CM, Gennis RB. A rapid and robust method for selective isotope labeling of proteins. Methods. 2011 Dec;55(4):370-8. doi: 10.1016/j.ymeth.2011.08.019.


    9. Iwasaki T, Kappl R, Bracic G, Shimizu N, Ohmori D, Kumasaka T. ISC-like [2Fe-2S] ferredoxin (FdxB) dimer from Pseudomonas putida JCM 20004: structural and electron-nuclear double resonance characterization. J Biol Inorg Chem. 2011 Aug;16(6):923-35. doi: 10.1007/s00775-011-0793-8. (Co-corresponding author)


    10. Iwasaki T. Iron-sulfur world in aerobic and hyperthermoacidophilic archaea Sulfolobus. Archaea. 2010 Sep 19;2010:842639. doi: 10.1155/2010/842639. (Corresponding author)


    11. Kounosu A, Hasegawa K, Iwasaki T, Kumasaka T. Crystallization and preliminary X-ray diffraction studies of hyperthermophilic archaeal Rieske-type ferredoxin (ARF) from Sulfolobus solfataricus P1. Acta Crystallogr Sect F Struct Biol Cryst Commun. 2010 Jul 1;66(Pt 7):842-5. doi: 10.1107/S1744309110019263. Epub 2010 Jun 24. PMID: 20606288; PMCID: PMC2898476.(Co-corresponding author)


    12. Iwasaki T, Samoilova RI, Kounosu A, Ohmori D, Dikanov SA. Continuous-wave and pulsed EPR characterization of the [2Fe-2S](Cys)3(His)1 cluster in rat MitoNEET. J Am Chem Soc. 2009 Sep 30;131(38):13659-67. doi: 10.1021/ja903228w. PMID: 19736979; PMCID: PMC2756718.(Co-corresponding author)


    13. Iwasaki T, Samoilova RI, Kounosu A, Dikanov SA. Two-dimensional pulsed electron spin resonance characterization of 15N-labeled archaeal Rieske-type ferredoxin. FEBS Lett. 2009 Nov 3;583(21):3467-72. doi: 10.1016/j.febslet.2009.09.050. Epub 2009 Oct 3. PMID: 19804777; PMCID: PMC2783746.(Co-corresponding author)


    14. Kounosu A, Iwasaki T, Baba S, Hayashi-Iwasaki Y, Oshima T, Kumasaka T. Crystallization and preliminary X-ray diffraction studies of the prototypal homologue of mitoNEET (Tth-NEET0026) from the extreme thermophile Thermus thermophilus HB8. Acta Crystallogr Sect F Struct Biol Cryst Commun. 2008 Dec 1;64(Pt 12):1146-8. doi: 10.1107/S1744309108035975. Epub 2008 Nov 28. PMID: 19052371; PMCID: PMC2593688.(Co-corresponding author)


    15. Iwasaki T, Ohmori D, Shimizu N, Kumasaka T. Crystallization and preliminary X-ray diffraction studies of the ISC-like [2Fe-2S] ferredoxin (FdxB) from Pseudomonas putida JCM 20004. Acta Crystallogr Sect F Struct Biol Cryst Commun. 2007 Dec 1;63(Pt 12):1014-6. doi: 10.1107/S1744309107045757. Epub 2007 Nov 21. PMID: 18084081; PMCID: PMC2344098.(Co-corresponding author)


    16. Iwasaki T, Kounosu A, Ohmori D, Kumasaka T. Crystallization and preliminary X-ray diffraction studies of a hyperthermophilic Rieske protein variant (SDX-triple) with an engineered rubredoxin-like mononuclear iron site. Acta Crystallogr Sect F Struct Biol Cryst Commun. 2006 Oct 1;62(Pt 10):993-5. doi: 10.1107/S1744309106034476. Epub 2006 Sep 30. PMID: 17012793; PMCID: PMC2225183.(Co-corresponding author)


    17. Iwasaki T, Kounosu A, Kolling DR, Lhee S, Crofts AR, Dikanov SA, Uchiyama T, Kumasaka T, Ishikawa H, Kono M, Imai T, Urushiyama A. Resonance Raman characterization of archaeal and bacterial Rieske protein variants with modified hydrogen bond network around the [2Fe-2S] center. Protein Sci. 2006 Aug;15(8):2019-24. doi: 10.1110/ps.052035406. PMID: 16877714; PMCID: PMC2242589.(Co-corresponding author)


    18. Iwasaki T, Kounosu A, Samoilova RI, Dikanov SA. 15N HYSCORE characterization of the fully deprotonated, reduced form of the archaeal Rieske [2Fe-2S] center. J Am Chem Soc. 2006 Feb 22;128(7):2170-1. doi: 10.1021/ja0562393. PMID: 16478144.(Co-corresponding author)


    19. Iwasaki T, Kounosu A, Tao Y, Li Z, Shokes JE, Cosper NJ, Imai T, Urushiyama A, Scott RA. Rational design of a mononuclear metal site into the archaeal Rieske-type protein scaffold. J Biol Chem. 2005 Mar 11;280(10):9129-34. doi: 10.1074/jbc.M414051200. Epub 2005 Jan 4. PMID: 15632131.(Co-corresponding author)


    20. Uchiyama T, Kounosu A, Sato T, Tanaka N, Iwasaki T, Kumasaka T. Crystallization and preliminary X-ray diffraction studies of the hyperthermophilic archaeal sulredoxin having the unique Rieske [2Fe-2S] cluster environment. Acta Crystallogr D Biol Crystallogr. 2004 Aug;60(Pt 8):1487-9. doi: 10.1107/S0907444904014295. Epub 2004 Jul 21. PMID: 15272185.(Co-corresponding author)

     


    講師　早川 清雄

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    3. Kato M, Yamaguchi M, Ooka A, Takahashi R, Suzuki T, Onoda K, Yoshikawa Y, Tsunematsu Y, Sato M, Yoshioka Y, Igarashi M, Hayakawa S, Shoji K, Shoji Y, Ishikawa T, Watanabe K, Miyoshi N. Non-target GC-MS analyses of fecal VOCs in NASH-hepatocellular carcinoma model STAM mice. Sci Rep. 2023 Jun 1;13(1):8924. doi: 10.1038/s41598-023-36091-7.


    4. Cheng Y, Manabe I, Hayakawa S, Endo Y, Oishi Y. Caspase-11 contributes to site-1 protease cleavage and SREBP1 activation in the inflammatory response of macrophages. Front Immunol. 2023 Jan 27;14:1009973. doi: 10.3389/fimmu.2023.1009973.


    5. Hayakawa S, Tamura A, Nikiforov N, Koike H, Kudo F, Cheng Y, Miyazaki T, Kubekina M, Kirichenko TV, Orekhov AN, Yui N, Manabe I, Oishi Y. Activated cholesterol metabolism is integral for innate macrophage responses by amplifying Myd88 signaling. JCI Insight. 2022 Nov 22;7(22):e138539. doi: 10.1172/jci.insight.138539.


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    7. Hayakawa S, Ohishi T, Oishi Y, Isemura M, Miyoshi N. Contribution of Non-Coding RNAs to Anticancer Effects of Dietary Polyphenols: Chlorogenic Acid, Curcumin, Epigallocatechin-3-Gallate, Genistein, Quercetin and Resveratrol. Antioxidants (Basel). 2022 Nov 28;11(12):2352. doi: 10.3390/antiox11122352. (Co-corresponding author)


    8. Yamaguchi F*, Hayakawa S*, Kawashima S, Asakura T, Oishi Y. Antitumor effect of memantine is related to the formation of the splicing isoform of GLG1, a decoy FGF binding protein. Int J Oncol. 2022 Jul;61(1):80. doi: 10.3892/ijo.2022.5370. (*: equal contribution)


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    14. Kawata K, Iwai A, Muramatsu D, Aoki S, Uchiyama H, Okabe M, Hayakawa S, Takaoka A, Miyazaki T. Stimulation of macrophages with the β-glucan produced by aureobasidium pullulans promotes the secretion of tumor necrosis factor-related apoptosis inducing ligand (TRAIL). PLoS One. 2015 Apr 13;10(4):e0124809. doi: 10.1371/journal.pone.0124809.


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    17. Hayakawa S*, Shiratori S*, Yamato H*, Kameyama T, Kitatsuji C, Kashigi F, Goto S, Kameoka S, Fujikura D, Yamada T, Mizutani T, Kazumata M, Sato M, Tanaka J, Asaka M, Ohba Y, Miyazaki T, Imamura M, Takaoka A. ZAPS is a potent stimulator of signaling mediated by the RNA helicase RIG-I during antiviral responses. Nat Immunol. 2011 Jan;12(1):37-44. doi: 10.1038/ni.1963. (*: equal contribution)


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    助教　草野 輝男

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    総説（英文）
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    助教　片山 映

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    助教　松村 智裕

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  • 教室メンバー

    大学院教授

    佐藤　　卓

    講師

    岩崎　俊雄
    早川　清雄

    助教

    草野　輝男
    松村　智裕（URA）
    片山　　映（共同研究施設分子解析研究室）

    テクニカル・サポートスタッフ

    川口　裕子
    始関　紀章

    研究補助員

    深澤　里沙子

    大学院生

    本田　梓（日本医科大学形成外科）
    杉野　健太（日本医科大学腎臓内科）
    杉田　洋佑（日本医科大学産婦人科）
    松田　　繁（日本医科大学産婦人科）